Le biodiesel, souvent aussi appelé EMC (ester méthylique de colza), peut être mélangé avec du diesel traditionnel et fonctionner comme carburant. De manière générale, un taux de mélange de 5% peut être utilisé dans n'importe quel véhicule, sans que des adaptations du moteur ou du système d'alimentation ne soient nécessaires. Le biodiesel peut aussi être utilisé pur, mais cette utilisation peut nécessiter une adaptation des véhicules.

Matières premières
Biomasse oléagineuse, huiles végétales, huiles usagées d'origine végétale ou animale.

Fabrication
Suivant les sites de production, le biodiesel se fabrique à partir de biomasse oléagineuse, qu'il faut alors presser, ou directement à partir d'huile. L'ester méthylique est obtenu par l'intermédiaire d'une estérification de l'huile à laquelle on a ajouté 10% de méthanol. En Europe, le biodiesel est principalement fabriqué à partir de colza (EMC).

Caractéristiques
La consommation de biodiesel est plus élevée de 5% par rapport au diesel traditionnel. Des additifs doivent y être ajoutés pour assurer le fonctionnement en hiver. Les moteurs des véhicules qui ne sont pas conçus pour rouler avec du biodiesel pur peuvent être endommagés (joints + direction).

Développement de la filière
Quatre grandes installations produisent du biodiesel en Suisse. Leur biodiesel est en majeure partie repris, puis commercialisé, par Agrola et EKURA. Le réseau de stations-service proposant un carburant composé de 5% de biodiesel est en pleine expansion. Le marché se compose aussi de petites unités de production. Elles utilisent le biodiesel pour leur consommation propre (exemple: une entreprise de transport).

Le biodiesel produit moins d'émissions de CO2, de monoxydes de carbone, d'hydrocarbures et de particules fines que le diesel traditionnel. Il n'émet pas de dioxyde de soufre. La quantité des émissions d'oxydes d'azote est, quant à elle, légèrement supérieure à celle d'un véhicule roulant au diesel traditionnel.