Une STEP souhaitant pratiquer la codigestion peut exploiter différentes synergies. Elle peut, premièrement, utiliser l'infrastructure existante, telle que la digestion, le stockage et l'utilisation de gaz. La codigestion peut être réalisée sans grande construction, mais il faut quand-même que la taille du digesteur permette d'accueillir les cosubstrats. Des espaces sont à prévoir pour la réception et la préparation des cosubstrats. Finalement, la STEP dispose aussi d'un personnel déjà formé au processus de digestion. 

Pour pouvoir maintenir les coûts d'élimination aussi bas que possible, la quantité annuelle de déchets organiques traités devrait être relativement élevée (au moins 1'000 à 1'500 tonnes). Ainsi, les coûts de traitement des déchets (y compris la collecte et le transport) peuvent être nettement inférieurs à ceux pratiqués par les usines d'incinération.

La codigestion augmente le taux d'auto-approvisionnement énergétique des STEP. Le courant vert produit peut être commercialisé.

De plus amples informations sont disponibles sur le site de l'OFEN.